烧烤竹签在出产和运送过程中易传染病毒、细菌以及某些化学物质。所以，新买的烧烤竹签能够先用自来水清洗。

日常中在清洗烧烤竹签时也要先把烧烤竹签外表冲净，再用洗洁精仔细搓洗烧烤竹签，搓洗烧烤竹签时力度要适中，不要猛搓。大都家庭洗烧烤竹签的方法很“粗犷”，抓着一把烧烤竹签用洗洁精猛搓，然后用清水冲刷，其实这样很容易使烧烤竹签尤其是没有保护层的“裸筷”变粗糙，发生许多纤细的凹槽、裂纹，导致病微生物残留。

有条件的可放入消毒碗柜中消毒、烘干，确保沥干后再储藏。

储藏烧烤竹签时一定要竖放，烧烤竹签盒应当选择镂空、底部不会积水的，并做到常常清洗、消毒。切勿选择强酸强碱洗涤剂，防止残留的化学物对人体构成损害。